- メール
- 電話
-
住所
北京市朝陽区中安盛業ビル
概要
ナノ細孔三世代シーケンシング計PromethION 24は、柔軟で大容量のデスクトップシーケンシングソリューションを提供することができ、大規模なプロジェクトや高スループット実験室での使用に最適です。このうち、PromethION 24は最大24個のフローセルを実行することをサポートし、データ産出量Maxは14 T basesに達することができる。各流動ユニットは独立して運行することができ、各種類の実験需要に基づいて必要に応じて長読み出し長シーケンシングサービスを提供することができる。設備集積の高性能計算モジュールは現実的な時の塩基識別と後続分析を実現でき、迅速なシーケンシング結果の取得を支援する。
製品詳細
一、製品の概要
ナノ細孔三世代シーケンサPromethION 24Minion、GridIONデバイスと同じコア技術を採用しているが、大規模な並列化処理を実現した高スループットのデバイスである。このシリーズの設備は同時に最大24個のシーケンシング実験を実行することを支持し、各実験も独立して展開することができる。また、ユーザーはPromethIONデバイスを使用してナノ細孔シーケンシングサービスを提供することもできます。
ナノ細孔三世代シーケンサPromethION 24シーケンシングユニットとAシリーズデータ収集ユニットから構成される：シーケンシングユニットには24個のシーケンシングポートが設置され、PromethIONフローユニットの挿入に供することができる、データ収集ユニットには高性能集積コンピュータと塩基識別加速器が搭載されている。この装置は、24個の流動セルから生成されたデータに対してリアルタイムの塩基認識を行うことができる。現在の化学試薬とソフトウェアのサポートの下で、単一PromethION流動ユニットのデータ産出量Maxは200 Gbasesに達することができる。
二、コア技術
Oxford Nanopore配列決定はナノ細孔単分子検出技術に基づいている。配列決定の際、核酸分子（DNA/RNA）は、モーターゼ駆動下で、ナノ細孔を単鎖状に塩基単位で通過する。塩基が通過すると、ナノ細孔内の電流強度が変化し、塩基（A、T、C、G）および修飾塩基に対応する電流信号に違いがある。デバイスはこれらの電流変化をリアルタイムで捕捉し、MinKNOW™などのソフトウェアを塩基配列に変換し、単分子直接配列決定を実現する。この技術はPCR増幅を必要とせず、塩基修飾情報を保持することができ、しかも読み取り長は制限されず、リアルタイムデータ分析を実現でき、携帯性と効率性を兼ね備えている。
三、コア性能優勢
サンプルのバッチ待ちを必要とせずに、オンデマンドで柔軟にシーケンスを決定する：需要に応じてシーケンシング時間と内容を自主的に選択することができ、流動ユニットは単独または協同運転をサポートし、サンプル量を揃えるために実験を延期する必要はない、単一の流動ユニットのシーケンシング容量はMinion流動ユニットの約6倍であり、異なる規模のデータ需要を満たす。
高スループットマルチタスク並列、適合サービス型ラボ：複数のDNAまたはRNA実験を同時に展開することをサポートし、バーコード技術を結合することでサンプル処理量をさらに増加させ、高スループットシーケンシングシーンに効率的に対応でき、ユーザーに専門的なナノホールシーケンシングサービスを提供することもできる。
配置の敷居が低く、各種実験室に適している：設備の敷地面積が小さく、既存の実験室施設を改造する必要がなく設置できる、包括的な技術サポートを搭載し、導入プロセスを簡略化し、小規模な科学研究実験室でも大規模なサービス機関でも容易に適合することができます。
高性能一体化計算、分析が効率的で便利：シーケンス測定と分析機能を一体化し、次世代CPU、4つのNVIDIA AシリーズGPU、60 TB SSDストレージ及び512 GB RAMを搭載し、計算力が強い、UbuntuオペレーティングシステムとMinKNOWソフトウェアをプリインストールし、電源を入れるとシーケンシングとリアルタイム分析を開始でき、結果の取得周期を大幅に短縮する。
四、応用分野
大型ゲノムまたはプロジェクトのシーケンシング：人類、大型動植物（例えば水稲、牛）などの複雑なゲノム組立、あるいは多段階一貫した大型科学研究プロジェクトに適合する。その24個の流動ユニットは同期運転が可能であり、単一流動ユニットデータ生成Max 200Gb，Minionより大きい容量は約6倍、大型ゲノムの繰り返し配列、構造変異領域を迅速にカバーし、強算力リアルタイム分析を結合し、プロジェクト周期を短縮することができる。
集団規模シーケンシング研究：人類疾病関連分析、動植物育種集団スクリーニングなどの情景に適用する。多様な本並列シーケンシングをサポートし、バーコード技術を組み合わせて数百個のグループサンプルを効率的に処理することができ、512 GB RAMと4個のNVIDIA A AシリーズGPUは大規模データの迅速な比較と変異検出を保障し、グループ遺伝学研究に高スループットソリューションを提供する。
高multiplex小型ゲノムまたは標的領域シーケンシング：細菌、真菌などの小型ゲノムの大量検出、或いは人類癌駆動遺伝子、薬物標的などの標的領域の分析。24個の流動ユニットは異なるサンプル群を分割処理することができ、単元の高容量はターゲット領域の深さカバーの需要を満たし、サンプルのロット待ちが必要なく、臨床検査、微生物リポジトリの構築などの高周波次小マスシーケンシング任務に適している。
全転写群（直接RNAまたはcDNA）研究：動植物全転写群の可変せん断分析、微生物転写動態モニタリングを支持する。直接RNA配列決定は塩基修飾情報を保持することができ、cDNA配列決定は低存在度転写本をカバーする、設備一体化計算能力はリアルタイムで全長転写本配列を解析でき、短読長接合誤差を回避し、遺伝子発現制御、疾病関連転写本スクリーニングなどの研究を支援する。
五、設備規格
| 寸法と重量 | PromethION 24シーケンシングユニット： 高さ190 x幅590 x奥行き430 mm、23 kg |
| データ収集ユニット仕様 | 60 TB SSDストレージ、512 GBメモリ、4枚のNVIDIA Ampere GPUカードをベース呼び出し加速に使用 |
| プリインストールソフトウェア | Linux（Ubuntu）をシステムとし、PromethIONをシステムとする（内部MinkNOW）、Doradoソフトウェア |
| 環境条件 | 室温（+18°Cから+22°C）で配列するように設計され、 ユーザーは、デバイスの後部と側面に30センチの隙間を残しておく必要があります。 注：計器後部は運転中に発熱する。 |
ゼブラフィッシュ（北京）科学技術有限公司は、機器のパラメータ、価格、選択、技術原理などの資料を提供し、より多くの情報を知りたいので、ご連絡ください。
