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住所
北京市朝陽区中安盛業ビル
概要
ナノ細孔三世代シーケンサPromethION 2 Soloは、最大2つのPromethION流速ユニットを動作させるように設計された小型デスクトップデバイスです。各フローセルは独立してアドレス指定可能であり、実験が同時に実行されても単独で実行されてもよいことを意味する。PromethION 2 SoloはGridION Mk 1またはユーザー計算機を挿入し、リアルタイムのデータフローと分析を実現することができる。
製品詳細
一、製品の概要
ナノ細孔三世代シーケンサPromethION 2 SoloMinionとGridIONデバイスで同じ技術を採用しています。同時にまたは単独で最大2つのシーケンシング実験を行うことができます。
ナノ細孔三世代シーケンサPromethION 2 SoloPromethIONストリームユニットを挿入できるシーケンシングポートが2つあります。このデバイスには統合コンピューティング機能はありませんが、GridION Mk 1または低規格を満たすスタンドアロンコンピュータを挿入することができます。これにより、デバイスは、2つの流量ユニットによって生成されたデータをリアルタイムで呼び出すことができる。現在の化学およびソフトウェアは、単一のPromethIONストリームユニットから最大290 Gbase*のデータを生成することをサポートしています（*理論出力Maxは72時間にわたって420 bpsシーケンシングに基づいています）。このデバイスは、外部コンピューティングデバイス（例えばGridIONデバイス）と接続するためのUSB Type-Cポートを備えているため、PromethION 2 Soloを設定するには施設をアップグレードする必要はありません。
二、コアテクノロジー
Oxford Nanopore配列決定はナノ細孔単分子検出技術に基づいている。配列決定の際、核酸分子（DNA/RNA）は、モーターゼ駆動下で、ナノ細孔を単鎖状に塩基単位で通過する。塩基が通過すると、ナノ細孔内の電流強度が変化し、塩基（A、T、C、G）および修飾塩基に対応する電流信号に違いがある。デバイスはこれらの電流変化をリアルタイムで捕捉し、MinKNOW™などのソフトウェアを塩基配列に変換し、単分子直接配列決定を実現する。この技術はPCR増幅を必要とせず、塩基修飾情報を保持することができ、しかも読み取り長は制限されず、リアルタイムデータ分析を実現でき、携帯性と効率性を兼ね備えている。
三、コア性能優勢
1.柔軟性：ナノ細孔三世代シーケンシング計PromethION 2 Soloは同時に2つの独立したPromethION Flow Cellを運行することができ、単一サンプルの二重通路の重畳深さ（例えば、ヒトの全ゲノムが100×以上に達する）或いは二重サンプルの並列シーケンシングをサポートし、柔軟に高スループットシーンの下で多様な本処理或いは高深度データの需要に適応し、操作の複雑度を下げる。
2.リアルタイムデータ取得：高スループット配列決定データ（単通路4000塩基/秒）を即時に生成でき、72時間の完全な配列決定プロセスの終了を待つ必要がなく、4時間以内に初歩的な変異分析結果を得ることができ、特に大規模な臨床応急検査、公衆衛生応答などの時効に対する要求が高いシーンに適している。
3. 既存のインフラストラクチャとの互換性：GridIONまたは実験室の既存のコンピュータシステムに直接接続でき、複雑なITアーキテクチャを追加構築する必要がなく、既存のワークフローにシームレスに溶け込み、導入コストと技術的敷居を下げることができる。
4.柔軟なオンデマンドシーケンシング：単一のFlow Cell独立運転または2つのFlow Cell同期起動をサポートし、サンプル量に基づいて動的にシーケンシング戦略を調整することができ、小ロットサンプルの迅速な検出に適しているだけでなく、大規模プロジェクトの高スループット需要にも満足しており、資源利用はより効率的である。
5. 無リード長の制限：短い断片から超4 Mb超長い断片までの核酸分子に対して配列決定を行うことができ、断片の長さに制限されず、効率的にヒトゲノムフィラメント、テロメアなどの複雑な重複領域と構造変異を解析することができ、伝統的な短読長配列決定の複雑なゲノム解析における限界を突破することができる。
四、応用分野
全ゲノム研究：単チャンネル8 Tbデータは人類全ゲノムの30×以上の深さ配列測定を実現でき、長読長助力T 2 T（末端から末端まで）の完全なゲノム組み立てを実現し、複雑な構造変異を解析することができる、
マクロゲノム深さ解析：土壌、海洋などの複雑な環境サンプルを支持するマクロゲノム深さ配列測定を高産生し、低存在度（＜0.1%）微生物を検出し、機能遺伝子を精確に注釈することができる、
臨床大規模検査：デュアルチャネル並列は数百個の臨床サンプル（例えばウイルス全ゲノム配列決定）を同時に処理でき、リアルタイムデータ分析は迅速な分類と変異監視を助け、公衆衛生応急応答を支持する、
動植物育種の研究：大型動植物ゲノム（例えば小麦、牛ゲノム）に高スループット長読長データを提供し、分子マーカーの開発と遺伝スペクトルの構築を支援する。
五、設備規格
| 寸法と重量 | 152 x 110 x 87 mm、重量1.5 kg |
| ポートのインストール | 1個のUSB Type-C（3.0、5 Gbps） 12 V直流バレル電源コネクタx 1 |
| インストールされているソフトウェア | P 2 Solo設定予備駆動 |
| 計算仕様 | 無 |
| 環境条件 | +18ºCから+25ºC*のシーケンスとして設計 |
| *電子機器の機能範囲+5ºCから+40ºC |
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