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illumina二世代シーケンシング計

ネゴシエーション可能更新05/07
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生産者
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概要

Millumina 2世代シーケンシング計MiSeqシステムは、さまざまなシーケンシング応用を通じてあなたの研究に便利を提供することができます。それは自動的に両端readを生成することができて、毎回の運行の産出は15 Gbに達して、それぞれのreadは600余りの塩基のシーケンシングデータを提供することができます。それが使用するライブラリー調製キットは、標的遺伝子配列決定、小型ゲノム配列決定、増幅子配列決定、16 Sマクロゲノム学などを含む様々な用途に最適化されている。

製品詳細

インミナ企業向けのMiSeqは、1つの機器に増幅、シーケンシング、データ分析を統合した新しいシーケンシング計で、1回の運転で1 Gbを超えるデータを生成でき、敷地面積はわずか2平方フィートです。MiSeqのプロセスと正確性は、迅速かつ経済的な遺伝分析の理想的なプラットフォームとなり、幅広い応用に適しています。同時にIlluminaはFDAに大量に購入され、FDAの認証を受けることになり、12年10月、MiSeqシステムのシーケンシングフラックスは8 G前後にアップグレードされた。アップグレードは2つの方面を通じて完成して、1つはcluster密度の増大で、アップグレード後にcluster密度は15-17 millionまで増加して、pair-end読み取りのreads数は30-34 millionまで増加します;一方、シーケンシングリード長によってスループットが向上し、シーケンシングリード長は2*300 bpに達し、同時にシーケンシング速度も向上した。現在、Broad研究院はすでに既存の試薬を利用して単端配列決定300 bpの読み取り長を実現しており、Illuminaは現在、内部配列決定はさらに2*400 bpのpair-end配列決定を完了している。これらは、高品質なデータ結果を前提にしていることを保証しています。


MiSeqパフォーマンスパラメータ


Illumina MiSeqシーケンシング時間とデータ量


リード長(bp) 時間 総データ量 Q30
1×36 ~4時間 540-610 Mb ﹥90%
2×25 ~5.5時間 750-850 Mb ﹥90%
2×100 ~16.5時間 3.0-3.4 Gb ﹥85%
2×150 ~24時間 4.5-5.1 Gb ﹥80%
2×250 ~39時間 7.5-8.5 Gb ﹥70%



Illumina MiSeq読み取り量比


実行タイプ フィルタによる読み取り(百万)
アップグレード前 アップグレード後
シングルエンド読み取り 5~7メートル 15~17メートル
エンドペア読み取り 10~14メートル 30~34メートル


ワークフロー


illumina二世代シーケンシング計MiSeq四だいとくせい

1、比較的短い実験周期:サンプル調製から8時間で100 Mを超える高品質シーケンシング結果を得ることができる。

2、便利なサンプル製造プロセス:50 ngDNAテンプレートが必要で、2時間の自動操作ですべてのサンプル製造作業を完了することができる。

3、シーケンシング原理:MiSeqはGAとHiSeqプラットフォームの辺合成辺シーケンシングの化学原理を継続する。

4、完全な統合機能:MiSeqは独立してクラスタ生成、双方向シーケンシング及びデータ分析を完成でき、経費と実験室空間がNGS研究の障害にならないようにする。


illumina二世代シーケンシング計MiSeq適用範囲

1、トランスクリプトームシーケンシング

パイセンノMiSeq配列決定プラットフォームは、ゲノム配列決定済み種の転写群解析プラットフォームである。同社の技術チームは現在、ゼブラフィッシュを含む多種の植物、動物の転写群の配列測定と分析を完了している。


2、マクロゲノム16 S rDNA単V領域配列決定

16 srDNAの単V領域(V 3 \ V 4)に対して高スループット配列測定を行い、細菌群と古生菌群を同定した。パイセンノの技術チームはIllumina MiSeqを用いて16 S rDNA V 4領域をシーケンシングし、Roche 454 FLX+シーケンシング16 S rDNA V 1 ~ V 3領域を結合して鶏の腸管環境細菌の同定に成功した。


3、Small RNAシーケンシング

1*35 bpの読み取り長さは小さなRNAのシーケンシング長さを組み合わせ、速度が速く、感度が高い。パイセンノの技術チームは現在、ガチョウの小さなRNA配列決定と多種の漢方薬の小さなRNA配列決定を完了している。


4、再配列:全ゲノム再配列、簡略化ゲノム配列、エキソン配列を含む。

Illumina MiSeqは微生物ゲノムの再配列決定に非常に適しており、実行するたびに微生物ゲノムの配列決定を完了することができます。2011年12月27日、パイセンノの技術チームはMiSeqの1回の運行を利用して同時に乳酸菌(Lactobacillus casei ZhangとLactobacillus casei P 8)の重配列を完成し、ゲノム被覆深さはそれぞれ404倍と213倍で、基準配列に比べて、ゲノムは全被覆を実現し、同時に挿入、欠失、SNP部位を含む多種の構造変異を検出し、全プラスミドを検出した。


データ表示

*上記の製品紹介およびデータはIlluminaから提供されています。Illuminaを参考にしてください。に準じる。