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上海市北青道路6725弄6号2棟2階B区
上海研謹生物科学技術有限公司
上海市北青道路6725弄6号2棟2階B区
同位体標識定量:
iTRAQ (isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation) &TMT (Tandem Mass Tags)AB Sciex社とThermo社がそれぞれ開発したポリペプチドの体外標識定量技術により、多種の同位体試薬を用いて蛋白質ポリペプチドN末端またはリジン側鎖基を標識し、異なる分子量の試薬を異なる源の試料に標識し、異なる試料間蛋白質群の比較を実現した。
iTRAQ実験手順:
1.サンプル準備:測定すべきサンプルを定量的にサンプルタンパク質濃度を算出する、
3.iTRAQ標識:ITRAQ試薬を室温まで平衡し、150μLイソプロパノールで溶解し、酵素分解ペプチド段を取ってiTRAQ試薬を添加後、室温で2 h反応し、水を添加して反応を停止し、等量で異なる群の試料を混合し、真空凍結乾燥試料:.
4.LC-MS-MS分析:ThermoのQ-Exactive Orbitrapを用いて直列質量分析鑑定を行う。
5.データ処理及び生信分析
結果表示:
全(ぜん)局クラスタリング熱マップの解析
*0のタンパク質数統計解析
実験周期及び交付基準
1.実験周期:4-6週間
2.交付基準:蛋白質定量結果、鑑定結果、質量分析原始データ、生信分析結果(G 0分析。KEGG分析など)
1.サンプルのジェネリック
2.サンプルの種類(組織or細胞or血液)
3.サンプルの数とグループ化
4.分析要件
参考文献
[1]XuX、Zhu Q、Zhang R、等.ITRAQに基づくオレイン酸誘導急性肺損傷の蛋白質群学的解析
マウス[J]。
[2]QuZ、GaoF、LiL、等.差異発現膜タンパク質の無標識定量タンパク質群学的分析
高病原性ブタの繁殖と呼吸症候群に感染する肺胞マクロファージ
ウイルス及びその減毒株[J]。蛋白質群学、2017:1700101。