画像解析の未来をひらく-Amira-Avizo 2025.1新リリース

リアルなレイエフェクトと鮮明なハイライト要素で複雑なシーンを表現するのは挑戦的なタスクです。従来のレンダリング方法では、細部がフラットになり、光が単調になり、データの最も重要な部分に集中するように誘導することは困難です。最新バージョンでは、Amira-Avizoは新しい3 Dレンダリング設定を提供し、驚くほど情報が豊富な視覚効果をもたらしています。これにより、レンダリング技術の強化、より広範で正確な光線制御、正確なフォーカスツールが導入され、被写界深度の調整、正確なフォーカス内容の選択により、特定のデータ領域に注目を向けることができます。

生命科学と材料科学の分野の研究者は、多くの重要な特徴がナノスケールに存在するため、より高いイメージング解像度を追求し続けている。このスケールの下で、微妙な違いが機能、性能、信頼性を決定している。より鮮明な画像はファジィな形態を測定可能で定量的なデータに変換し、タンパク質相互作用、膜組織、粒界挙動及び欠陥動態の背後にあるメカニズムを明らかにすることができる。画像解析は、画像形成の詳細が増加するにつれて、それに応じて改善されなければならない。最新バージョンでは、Amira-Avizoソフトウェアは2.5 D分割を実現し、2 D分割よりも信頼性の高い画像解読を提供することで構造の連続性を維持しています。これらの革新的なモデルは、深度感知を持つ3 D環境を提供し、大量の画像リソースを必要としない。

画像は嚢胞膜の三次元構造を示している。データの出所：EMPIAR database 11830-doi.org/10.1101/2024.12.28.630444

高品質な分割と3次元再構築を実現するためには、科学者たちは注目されている構造を正確に表示しなければならない。手動ツールを使用して寸法を記入すると、時間がかかり煩雑になる可能性があります。Amira-Avizoソフトウェアの最新バージョンには、元のデータから結果へのより迅速な変換を可能にするための新しい人工知能支援選択ツールが導入されています。

固定的で非適応的なアルゴリズムを使用して強力な分割モデルを構築することは非常に困難である。静的増強方式は内容を問わず同じ数の画像クロップを生成し、これによりワークフローが硬直化し、実験プロセスを遅らせ、実験結果に影響を与える。今回の更新では、定義した関心のある領域に合わせて調整し、最適な数の拡張画像ブロックを生成する動的プロセスを導入しました。15%のトレーニング時間しか使用していない場合には、かなりの品質と性能を持つモデルをトレーニングすることができ、大幅に時間を節約することができます。新しいAI機能は、一般的なモデル管理タスクの実行、TensorBoardでのトレーニングプロセスの表示、モデルの評価、関心のある各領域での予測結果の可視化、分割指標の表示を含むように実装されています。

画像はAmira-Avizoソフトウェアにおける鼻ウイルス粒子感染癌細胞の三次元構造を可視化し、同時にこの画像は新しいAIモデルマネージャと一緒に提示することができる。データソース：EMPIAR database-12270.

レポートワークスペースはAmira-Avizo 2025.1に組み込まれており、カスタマイズされたレポートテンプレートを厳格に管理し、自動化されたレポートの効率的な生成を実現できます。この新しいワークスペースを使用すると、3 D結果をより簡単に信頼性の高いドキュメントに変換でき、プロセスをより省力化し、より一貫性を持たせることができます。

画像はレポートの例を示しています。

サンプルは自動車用複合繊維である。

新しい機能はクリックするだけで入手でき、バージョン2025.1と互換性があります。これらはすべて無料のアップグレードパッケージで、新しいワークフローを実現したり、古いワークフローを代替したりすることができます。

• インスタンス分割Xtra：Cellpose-SAM方法を用いて2 D画像を迅速かつ高品質なインスタンス分割を行う。

• 分割データ中のオブジェクトを異なる特徴に基づいて分類し、そのサブカテゴリを識別する。

例示的な分割拡張機能を用いた電池粒子の例示（左図）

及びめっき層電池の例示的な分割展示（右図）。