Ribo-seqテクノロジサービス

Ribo-seqテクノロジサービス

技術原理

タンパク質は生命活動の主要な担い手であり、翻訳制御は細胞内の重要な制御方式でもある。翻訳はリボソームがmRNAテンプレートを読み取ってタンパク質合成の過程を指導することであり、遺伝子発現の重要なステップである。翻訳の過程は厳格に制御され、多くの疾患は神経退行性疾患、貧血症、発達障害などの翻訳異常と関連している。リボソームの構造と機能の研究は比較的に透徹しているが、翻訳過程の制御メカニズムについてはさらに深く研究する必要がある。

リボソーム印影配列決定（Ribosome profiling，リボース配列)、体内の翻訳状態を詳細に検出することができる。リボース配列の技術的コアは、リボソームに結合したmRNAと翻訳されている約30個のヌクレオチドを識別することである。リボソーム結合したmRNA断片を配列決定し、リボソームの翻訳中の位置を正確に記録することができる。書き起こしグループとリボース配列データを組み合わせて分析することで、タンパク質の合成速度を算出することができる。

技術的特徴

リボース配列タンパク質合成の時間、場所、位置、どのタンパク質が合成されているか、およびタンパク質合成の制御メカニズムを明らかにすることができる。リボース配列転写群からタンパク質群学への橋渡しを構築し、動物、植物、微生物の研究に広く応用され、成長発育、形態構築、疾病発生、逆境ストレス応答の制御メカニズムを明らかにするために用いられている。

リボース配列転写本の翻訳活性の研究、翻訳開始部位の同定、ORF位置と蛋白質の翻訳制御メカニズムに応用する。

リボース配列技術はすでに動物、植物と微生物の研究に広く応用され、成長発育、形態構築、疾病発生、逆境ストレス応答の制御メカニズムを明らかにするために用いられている。とにかく、リボース配列ゲノムレベルからタンパク質の翻訳状況を検出し、翻訳中のmRNA配列情報を取得し、翻訳制御メカニズムを解析することができる。

藍景科信優勢

実験周期が速く、品質が高く、結果が安定して信頼できる。

豊富な種の経験。

Ribo-seqテクノロジサービス実験フロー

ひょうじゅんせいしんぶんせき

（1）生データフィルタリングとシーケンシング品質評価

（2）リボソームRNA、tRNA、sRNA等の比較除去

（3）Reads長さ分布統計と長さフィルタリング

（4）比較参照ゲノム

（5）シーケンス飽和度解析

（6）ゲノム上のRFの分布統計と分類

（7）三塩基リズム解析

（8）翻訳遺伝子の統計と発現量の分析

（10）群間差異翻訳遺伝子解析

（11）差異翻訳遺伝子のGOとKEGG機能濃縮分析

リボース配列RNA−seqとの連携解析

（1）翻訳効率計算

（2）Ribo−seqとRNA−seqの相関解析

（3）翻訳効率と転写レベルの関連分析

分析プロセス

実験事例

サンプル送付要求

（2）動物組織サンプル：推奨サンプル量≧300 mg。

（3）植物組織サンプル：推奨サンプル量≧500 mg。

サンプルのグループ化

少なくとも2組のサンプル、対照群と実験群を含み、サンプル数提案：3 Vs 3。

参考文献

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