免疫共沈殿試験

RNA結合DNAと蛋白相互作用：CHIRP

免疫共沈殿試験（Chromatin Isolation by RNA Purification，CHIRP）は、体内でRNAに結合されたDNAとタンパク質の相互作用を検出する方法であり、InCRNAcircRNA、タンパク質、DNAの3つの相互関係を同時に分析することができる。

CHIRP実験意義

IncrNAはタンパク質、DNA、RNAと相互作用し、多様な機能を実現することができ、CHIRPはIncrNAと相互作用するDNAタンパク質の機能と作用機序を検討することができ、関連する科学研究活動の有力なツールである。IncrNAの研究は見かけ上の遺伝調節などの生命活動に重要な役割を果たし、CHIRPは研究である

InCRNAの重要な技術手段は、全ゲノム範囲内でRNAと染色質の相互作用を同定し、定性、定量及び定位の分析を行うことができる。

CHIRP実験原理

CHIRP（Chromatin Isolation by RNA Purification）は、ビオチンを結合した核酸プローブによって標的RNAを引き抜くことで、それと共同作用するDNA染色体断片（DNAとタンパク質複合体）が吸着され、後にqRT-PCR.WB.シーケンス解析や質量分析などによってRNA.DNAとタンパク質を検出することができる。

CHIRPの実験フロー

①プローブ設計：アンチセンス穿孔ヌクレオチドプローブの設計：

②細胞培養、

③破砕細胞：

④ビオチン標識DNAプローブとRNAのハイブリダイゼーション、

⑤クチャクチャ

⑥RNA、DNA及び核酸結合タンパク質の抽出、 .

⑦分析測定。,

結果表示

実験完了周期及び交付基準

1.実験周期：1-3ヶ月

2.交付基準：CHIRP鑑定結果報告、分析報告、実験報告（試薬、消耗品、実験手順）、生データなど

実験で顧客と確認する必要がある情報

1.目的遺伝子とタンパク質情報。

2.サンプルタイプとジェネリック

3.生信分析が必要か

参考文献

［1］lyer S、Modali SD、Agarwal SK.長非符号化RNA MEG 3は機能性膵神経内分泌腫瘍細胞における発癌シグナルの見かけ上遺伝的決定因子である［J］。分子と細胞生物学、2017：MCB.00278-17。

[2]朱、張。RNA精製分離染色質（ChIRP）によるRNAと染色質の相互作用を理解する。J分子生物学的方法、20161480。

［3］ZhuJJ、FuHJ、Wu Y.G、等.IcRNAsの機能及びタンパク質との相互作用の研究［J］。科学

中国生命科学、2013、56（10）：876-885。

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