亜細胞蛋白質グループ学のワークフロー全攻略（質量分析と

亜細胞蛋白質グループ学のワークフロー全攻略（質量分析とSILAC技術）検査技術サービスの詳細

ポストゲノム時代において、サブ細胞dànbàizhā群学（subcellular proteomics）は細胞機能、信号経路及び疾病機序を明らかにする重要な研究方向になりつつある。全細胞レベルのdànb izhā群学に比べて、サブ細胞レベルの研究は特定の細胞器（ミトコンドリア、内質網、細胞核など）内の蛋白質発現、定位及び動的変化に焦点を当て、それによってより高い空間分解能のデータ支持を提供する。

一、なぜサブ細胞dànbàizhā群学を選択したのか。

疾病バイオマーカーのスクリーニングと信号経路の研究において、伝統的なdànbàizhé群学は広範な成果を収めているが、その空間分解能はしばしば制限されている。例えば、腫瘍細胞において、全タンパク質群レベルの発現変化は、細胞器レベルのタンパク質再配置（protein translocation）現象を直接反映するものではない。

• 異なる細胞器間のタンパク質の動的輸送を明らかにした。

• 疾患に関連する局所タンパク質発現異常を識別する。

• 時空次元におけるタンパク質ネットワーク構造を再構築する。

この研究方向では、高解像度質量分析プラットフォームと定量的な標識戦略の併用が特に重要である。

二、亜細胞dànbàizhéグループ学のコアワークフロー

1、サンプルの調製と亜細胞成分の分離

高品質の亜細胞分離はプロセス全体の基礎である。現在主流の方法は次のとおりです。

• 差動遠心分離：ミトコンドリア、核、小胞などの大部分の細胞器の大まかな分離に適している。

• 免疫親和分離：抗体により特定の細胞器を濃縮し、遠心分離が困難な細胞構造に適用する。

• 亜細胞dànb izhā図法（Subcellular Localization Mapping）：SILACなどの技術を結合し、空間解析力を高める。

2、蛋白質抽出と酵素切断

異なる細胞器におけるタンパク質の種類と存在度の差が顕著であるため、タンパク質抽出時に緩衝液系を最適化する必要がある、例えば：

• m 243 dガリウムnbガリウムiが濃縮されたサンプルには、高塩+非イオン性洗浄剤を使用することを推奨します。

• 核酸を含む核酸成分は、試料の粘度を低下させるために核酸酵素を添加する必要がある。

酵素カットは通常、y−237 d−nb−λiméi（Trypsin）を用い、必要に応じてLys−Cなどの補酵素を結合し、複雑なタンパク質の切断効率を増強する。

三、定量策略の詳細解：亜細胞dànbàizā群学におけるSILACの優位性

1、SILACとは？

SILAC（Stable Isotope Labeling by Amino acids in Cell culture）細胞培養過程においてジアゾ同位体を含むアミノ酸を導入することにより、dànbàizāレベルの相対定量を実現する代謝標識戦略である。その利点は次のとおりです。

• 化学修飾を必要とせず、非生理的変化の導入を避ける。

• 質量スペクトルと天然互換性があり、定量的正確性が高い。

亜細胞dànbàizhà群学では、SILACは特に次の用途に適しています。

• 蛋白位置決めスペクトル構築：異なるSILAC標識群は異なる細胞器をシミュレーションし、ラベル強度と分布モードを通じて位置決め推定を行う。

• 動的輸送研究：処理前後のSILACラベル強度変化、蛋白移行傾向を明らかにする。

• 高フラックススクリーニング条件下でのグループ学的比較。

2、SILAC vsその他の定量技術（TMT、Label-free）

四、質量分析とデータ解読

1、計器選択：高解像度vs高フラックス

低存在度タンパク質および同位体ラベルの検出能力を向上させるために、一般的には、Orbitrap Exploris、timsTOFシリーズなどの高分解能質量分析計の使用が推奨されています。

2、データ処理フロー

一般的な分析プロセスには、次のものがあります。

• 生データ前処理（Raw to mzML）。

• サブ細胞局在予測ソフトウェア支援（MetaMass、SubConsなど）。

• 富化分析と機能注釈（GO、KEGG、Reactome）。

実際のプロジェクトでは、データの品質制御が特に重要です。例：

• 蛋白質被覆率は均衡しているか。

• 同位体ピーク分解能は十分であるか。

• ロット効果干渉があるかどうか。

亜細胞dànbàizhā群学は蛋白質発現と細胞機能を結ぶ重要な架け橋である。質量スペクトル感度の向上と定量技術の多様化に伴い、サブ細胞レベルのjīngqè群学は複雑な生命現象bùk huòquēを理解する手段となっている。将来的には、空間多群学、AI補助定位予測、単細胞亜細胞群学などの新しい方向がさらに研究境界を広げるだろう。

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百泰パイク生物科学技術特色プロジェクト

一、蛋白質配列測定

百泰パイクバイオテクノロジーは、Thermo社が新たに発売したObitrap Fusion Lumos質量分析計及び島津社のエドマン分解配列測定システムを用いてdànbàizhneneneew配列を分析し、dànbàizhàのアミノ酸組成分析、Nduāncù、Cduāncùと全配列分析、及びエドマン分解に基づくdànb堛izh壩N端シーケンス分析サービス。未知の理論配列のd nb izhéに対して、abinitioシーケンシング法に基づくd nb izéabinitioシーケンシングサービスを提供し、蛋白質配列を分析する。

※サービスのメリット：

1.現在世界で先進的な質量分析機器Obitrap Fusion Lumosを採用する、

2.測定された標的タンパク質配列の100%の被覆を実現することができ、

3.タンパク質N末端の最大70アミノ酸配列を測定することができ、

4.多種の形式のサンプルを測定することができる：蛋白質溶液、PVDF蛋白質ストリップ、

5.サンプル使用量が低い：蛋白サンプルは5-10 ugだけで、検査を完了することができる、

6.配列決定はN末端閉鎖、PEC及びグリコシル化などのN末端修飾の影響を受けない。

二、dànbàizh撡組学

百泰パイク生物科学技術はThermo FisherのOrbitrap Fusion Lumos質量分析プラットフォームを用いてNano-LCと結合し、定量的なdànbàizhà、ポリペプチド、翻訳後修飾タンパク質群学などの多種のdànbàizà群学分析サービスを提供する。また、百泰パイク生物科学技術は新たにtimsTOF Proに基づく4 Ddànbàizhā学サービスを提供し、微量サンプル蛋白群学、大サンプル群医学及び高フラックス修飾群学などの研究を支援した。

※サービスのメリット：

1 .高スループット定量タンパク質分析：多対照群の大規模実験分析により、新しいバイオマーカーを発見した、

2.体内体外における多種のdànb izhneneneew標識方法は、組織、細胞、血液などの多種のサンプルの分析に適している、

3.質量分析感度が高く、実験結果の再現度が高い、

4.比較的低い存在度蛋白質を測定でき、線形範囲が広い、

5.zhuānyè生物情報学分析、分析はより系統的で正確である。

三、単細胞質量分析フロー技術分析

ヘテパイク生物科学技術はFluidigm質量スペクトル流式システムを用いて単細胞質量スペクトル流式技術分析を行い、金属元素標識物（通常は金属元素標識の特異抗体）を用いて細胞表面と内部の分子を標識し、その後、流細胞原理を用いて単細胞を分離し、さらに誘導結合プラズマ質量スペクトル（ICP-MS）を用いて単細胞の原子質量スペクトルを分析し、zuhun後に原子質量スペクトルデータを細胞表面と内部の信号分子発現量に変換する。

※サービスのメリット：

1.技術が先進的で、技術の空白を埋める

金属標識抗体技術を用いて、伝統的なフロー蛍光チャンネルが少なく、相互影響しやすいという問題を回避した。単細胞レベルで多種の指標を同時に特徴づけることができ、百泰パイクバイオテクノロジーは51個の目標タンパク質を同時に検出することができる。

2.分析数量が多く、コストが低い

単細胞RNAseqはコストなどの要素によって制限され、すべてのサンプル細胞がまとめられた分析数は一般的に2 x 10 ^ 4個前後であるが、フロー質量分析技術は1回（単サンプル）で少なくとも10 ^ 5の細胞を分析でき、数量レベルの向上を実現し、コストは単細胞RNAseqより高くない。

3.応用の将来性が大きい

①流動式質量分析結果は細胞亜群の変化を提供でき、臨床診断、疾病機序研究などの面で極めて大きい研究見通しがある、

②金属ラベル技術を他の技術と結合することにより、新たな応用方向がある。通常の蛋白質のほか、質量分析流細胞技術は蛋白質翻訳後の修飾にも使用できる、

③細胞生存率、細胞サイズ、mRNA転写子発現量、DNA合成速度及びプロテアーゼ活性などを測定することができる。

四、高精度質量分析に基づく免疫ポリペプチドのグループ学的分析及び新抗原発見

百泰パイクバイオテクノロジーの高精度質量分析に基づく免疫ポリペプチドのグループ学的分析及び新抗原発見ワンストップソリューションには、私たちが専有し、高感度な免疫ペプチドの濃縮と同定案が含まれている。10000以上のI型ポリペプチドと10000以上のII型ポリペプチドの同定と識別を支援することができます。我々が最適化した高スループット免疫ポリペプチド群学分析プラットフォームを用いて免疫ペプチド群学分析を行い、zuhāの小さい試料材料から重複可能な識別と定量を行うことができる。このサービスは大規模な研究に応用でき、科学研究者が癌、免疫疾患及び伝染病の解決策を探し、未知の標的を深く掘り下げることを目的としている。

五、生物薬物の特徴

百泰パイクは高分解能質量分析技術に基づいて、MALDI TOF，高効率クロマトグラフィー分離技術は、一連のwタングステンの生物薬物分析方案を提供し、dタングステン、ポリペプチド、抗体、ワクチンなどの生物製品のアミノ酸組成と一級構造分析から、製品変異性と純度分析までを提供する。良質な生物医薬品分析サービスを提供し、生物医薬メーカーの生物医薬品の品質向上を支援することを目的とする。

百泰パイク生物科学技術七大検査プラットフォーム

百泰パイク生物科学技術-生物製品の特徴付け、生物質量スペクトルの多群学的良質サービス業者

北京百泰パイク生物科学技術有限公司は生物/製薬と医療機器業界に品質制御検査とプロジェクト検証などのzhuānyèサービスを提供することに力を入れている。会社の実験室はNMPA、ICH、FDAとEMAなどの法規と指導原則に従い、CNAS/ISO 9001二重品質体系認証を通じて、完備した品質体系、データ冷熱/異郷バックアップ、設備定期計量/期間検査、ソフトウェア監査追跡、顧客に一体化ソリューションと技術サービスを提供し、新薬研究開発、薬物申告登録と生産放行をサポートする。

2.国家CNAS実験室の認可を得て、顧客に世界の薬政法規に符合する薬物品質研究サービスを提供する、

3.業務範囲はdànbàizhā群学、ポリペプチド群学、代謝群学、生物医薬品特性評価、単細胞分析、単細胞質量スペクトル流式、生信雲分析及び多群学生物質スペクトル統合分析などをカバーする、

4.七大品質制御検査プラットフォーム、あなたのワンストップサービス需要を満たす、

5.サービス3000+企業、10000+顧客の選択、

6.良質な生体質量分析サービスを提供することに力を入れています！

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