一般的に、イオンクロマトグラフィーの操作中によく見られる故障は次のようなものがあり、化学実験員はイオンクロマトグラフィーの簡単なメンテナンスと操作を学ぶ必要がある。（本欄の問題のメンテナンスは参考にするだけで、実際のメンテナンスで部品がこれと異なる場合は、次の操作を参照することができます）