1、かび変化：貯蔵期間中、種子の水分が高すぎ、呼吸作用が旺盛で、大量の呼吸熱と水分が発生し、種子堆積の発熱を引き起こしてかび変化する（例えば、地元の夏播種種子、東北種子の水分が高く、＞14%〜6月に山東省でかびが発生する）。

2、薬害：高水分種子は呼吸が盛んで、薬剤の燻倉時に薬量を吸いすぎて薬害が発生し、それによって生活力を低下させる。（ストック種子の越夏燻倉前に種子を干さなければならない）。

3、凍害：高水分種子は凍害が発生しやすく、発芽率を低下させる。（凍害胚と胚乳の分離が発生し、胚部が黒ずんでいる：水分20%は-2℃で冷凍すべきでない、18%は-5℃で冷凍すべきでない、17%は-8℃で冷凍すべきでない）。

そのため、種子は加工、包装前、燻蒸前、貯蔵期間中、水分測定を行わなければならない。安全な水分基準を満たしていない種子の入庫は絶対に許されない。

種子の水分測定方法は多く、要約すると、標準測定法とその他の測定法である。標準推量測定方法：乾燥減量法、正式検査報告用。その他の方法は：快速法、滴定法、蒸留法がある。その中の高速法：電子機器（例えば容量式、抵抗式穀物水分測定器）。