1960年代に緑色蛍光蛋白質が発見されて以来、各種蛍光蛋白質（FP）とその変異体は可視スペクトル全体にわたって開発されてきた。これらの遺伝子がコードする蛍光タンパク質は細胞生物学の分野で革命を起こした。青緑色蛍光蛋白（CFP）はFRETなどの多色領域への応用で広く注目されている。これは、CFPの励起及び発光光の波長範囲が使用されることが少なく、むしろ様々な蛍光基の多重化の理想的な選択となるためである。蛍光タンパク質技術と自動顕微鏡技術の発展により、研究者は生細胞中の遺伝子機能と動的過程をより深く研究することができるようになった。蛍光蛋白質は、関心のある遺伝子に融合したレポーター遺伝子としてよく用いられる。FPによって標識された遺伝子産物が細胞によって正常に発現されると、タンパク質、細胞器、および細胞間隔の機能を研究し、その位置を追跡するために画像化することができる。