カラムの適切な使用と維持は非常に重要であり、少しでも油断するとカラム効果が低下し、寿命が短くなり、破損することがあります。クロマトグラフィー操作中には、カラムを維持するために次の問題に注意する必要があります。

①圧力と温度の急激な変化といかなる機械的振動を避ける。温度の突然の変化やカラムを高い位置から落下させることは、カラム内の充填状況に影響します。カラム圧の急な上昇や低下もカラム内充填剤を衝動的に作用するため、流速を調節する際にはゆっくりと行うべきであり、バルブの注入時にバルブの回転が遅すぎることはできない（前述の通り）。

②溶媒の組成、特に逆相クロマトグラフィーでは、有機溶媒から直接すべて水に変えるべきではなく、逆もまた然りである。

③一般的にカラムは反転できないが、生産者がカラムが反転できることを指定した場合にのみ、カラムのヘッドに残っている不純物を反転除去することができる。そうしないと、バックフラッシュは急速に柱効果を低下させます。

④固定相が破壊されないように適切な可動相（特にpH）を使用することを選択する。試料注入器の前に予備カラムを接続することができ、分析カラムが結合シリカゲルである場合、予備カラムはシリカゲルであり、分析カラム中のシリカゲルマトリックスが溶解するのを避けるために、分析カラムの前に移動相を事前にシリカゲルで「飽和」させることができる。

⑤マトリックスの複雑なサンプル、特に生体サンプルを直接カラム内に注入することを回避するには、サンプルを前処理するか、注入器とカラムの間に保護カラムを接続する必要があります。保護柱は一般的に似た固定相を埋めた短い柱である。保護柱は可もなく、常に交換しなければならない。

⑥常に強い溶媒でカラムを洗い流し、カラム内に保存されている不純物を除去する。洗浄を行う際には、対流路システムにおける可動相の置換は混和溶媒で徐々に遷移しなければならず、各可動相の体積はカラム体積の20倍程度、すなわち従来の分析には50 ~ 75 ml必要である。

以下にいくつかのカラムの洗浄溶媒と順序を挙げ、参考とする：シリカゲルカラムはn−ヘプタン（またはヘプタン）、ジクロロメタン、メタノールで順次洗浄し、それから逆の順序で順次洗浄し、すべての溶媒は厳格に脱水しなければならない。メタノールは残留した強極性不純物を洗浄することができ、シランはシリカゲル表面を再活性化させた。反転カラムは、水、メタノール、アセトニトリル、モノクロロメタン（またはクロロホルム）の順に洗浄し、さらに逆の順に洗浄する。次工程分析用の移動相に緩衝液が含まれていなければ、zui後に水で洗い流す工程を省略することができる。モノクロロメタンは残留した非極性不純物を洗浄することができ、メタノール（アセトニトリル）洗浄時に100 ~ 200μlのテトラヒドロフランを数回繰り返し注射することは強疎水性不純物を除去するのに役立つ。テトラヒドロフランとアセトニトリルまたはメタノールの混合溶液は脂質を除去することができる。ジメチルスルホキシドを数回注射することもある。また、アセトニトリル、アセトン及びトリフルオロ酢酸（0.1%）の勾配溶出によりタンパク質汚染を除去することができる。

陽イオン交換カラムは希酸緩衝液で洗浄し、陰イオン交換カラムは希アルカリ緩衝液で洗浄し、交換性能の強い塩を除去し、水、メタノール、ジクロロメタン（固定相表面に吸着した有機物を除去する）、メタノール、水で順次洗浄する。

⑦カラムを保存する時、カラム内をアセトニトリルまたはメタノールでいっぱいにし、カラムジョイントを締め、溶剤の揮発乾燥を防止する。バッファ溶液をカラム内に一晩以上静置することは、できるだけ禁止されています。

⑧カラムの使用中、圧力が高くなると、焼結フィルタが塞がれている可能性があるので、フィルタを交換するか、取り出して洗浄しなければならない。もう1つは、柱の内部に高分子が進入し、柱頭が汚染される可能性がある、カラム効果が低下したり、クロマトグラフィーピークが変形したりすると、カラムヘッドが陥没し、デッドボリュームが増加する可能性があります。

後の2つの状況が発生した場合、カラム継手を慎重に捻って、クリーンな小鋼でカラムフィラーを1 ~ 2 mmの高さ（汚染されたフィラーをきれいに取ることに注意する）に取り出してからカラムフィラーを平らにします。次に、カラムを適切な溶媒で湿らせた固定相（カラム内と同じ）で埋め、平らにし、カラムジョイントを締めます。このようにして処理後のカラム効率は改善されたが、新しいカラムのレベルに回復するのは難しい。