温度制御異常は効率低下の核心要素の一つである。水浴温度を低く設定すると、溶媒分子の揮発速度が遅くなり、濃縮時間が長くなることがあります。例えば、エタノール溶液を濃縮する場合、水浴温度が70℃（エタノール沸点78℃）未満であると、蒸発効率が30%以上低下する可能性がある。また、加熱モジュールの故障や温度センサのドリフトも実際の温度と設定値の偏差が大きすぎることを招き、較正温度計を用いて加熱モジュールの温度均一性を多点検出し、表示温度と実際の温度偏差≦±1℃を確保する必要がある。

気流制御の不適切さは蒸発速度に直接影響する。窒素ガス流量が不足すると、溶媒表面の気液バランスが効果的に破壊されにくくなり、揮発速度が低下する。例えば、100 mL水サンプルを濃縮する場合、窒素ガス流量が200 mL/minから100 mL/minに低下すると、濃縮時間が50%延長される可能性がある。また、空気針が詰まったり、空気路が漏れたりすると、空気流が不安定になることもあります。石鹸水で管路の接続部に漏れがないかどうかを検査し、細い針で詰まった空気針を疎通したり交換したりする必要があります。

設備の状態はメンテナンスと同様に重要である。長期使用後、気体針は溶媒の結晶化や不純物堆積によって詰まる可能性があり、定期的にアセトンやエタノールで洗浄する必要がある。同時に、シールリングが老化するとガス路が漏れてしまうので、すべてのシールリングとOリングに亀裂がないかどうかをチェックし、必要に応じてフッ素ゴム製シールを交換する必要があります。また、水浴槽の水質が濁ったりスケールが堆積したりすると伝熱効率に影響を与え、毎週蒸留水や脱イオン水を交換し、水槽内壁のスケールや藻類を除去する必要があります。

操作規範と環境制御も無視できない。試料の体積が大きすぎたり、針の高さが適切でない（液面から5 mmを推奨）ことは、スパッタや揮発異常を引き起こす可能性があり、試料の体積に応じて針の位置を調整する必要がある。実験室の環境温度が高すぎる（＞35℃）または湿度が高すぎる（＞80%）と、熱の散逸が加速し、濃縮効率に影響を与え、設備を通風が良く、温湿度が適切（20-25℃、40-60%RH）な環境に置く必要がある。